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굴러간 도토리를 쫓던 스크랫이 자신도 모르는 사이에 빙하 밑에 숨겨져 있던 우주선을 작동시킨다. 스크랫을 태운 우주선은 태양계를 위협하는 행성 충돌 사건을 일으키고, 이로 인해 거대한 소행성 하나가 지구로 떨어지기 시작한다. 이러한 사실을 알리 없는 매니와 엘리 부부는 친구들과 함께 결혼기념일 축하 파티를 연다. 파티가 한창일 때 외동딸 피치가 줄리언과 결혼하는 대로 부모 곁을 떠나겠다는 폭탄 선언을 한다. 충격을 받은 매니가 사태를 수습할 겨를도 없이 긴박한 상황이 닥쳐온다. 하늘에서 불꽃이 터지고 별똥별 비가 내리자 매니 일행은 서둘러 동굴로 대피한다. 한편 땅속 공룡 세계에 살고 있던 족제비 벅은 우연히 발견한 예언의 석판에서 소행성이 포유류를 멸종시키는 그림을 보고는 지상으로 돌아온다. 곧 벅과 빙하기 친구들은 소행성으로부터 지구를 구할 방법을 찾기 위해 모험을 시작하는데…